常瑶1, 苏国生2, 李艳华3, 李想1, 麻柱1,3*, 王雅春1*
(1. 中国农业大学动物科学技术学院,北京 100193;2. 奥胡斯大学遗传与基因组中心,切勒 8830;3. 北京奶牛中心,北京 100192)
【目的】估计遗传参数时,可通过系谱信息构建亲缘关系矩阵,从而明确个体间的遗传联系。但在实际应用中,系谱记录存在缺失或错误的情况。在我国,规范化的系谱登记起步较晚,牧场管理尚不完善,奶牛系谱记录存在更高的错误率。本研究收集荷斯坦牛0~12月龄各月龄体重,基于系谱信息(LM_A)和系谱-基因组信息构建亲缘关系矩阵(LM_H),结合不同模型,拟确定一套较为全面、准确的遗传参数,为建立荷斯坦牛生长性状基因组选择体系提供理论参考依据。
【方法】于2014—2020年测定并收集了7 122头荷斯坦牛32 338条0~12月龄体重数据,分别利用系谱信息(LM_A)和系谱-基因组信息构建亲缘关系矩阵(LM_H),基于母体效应动物模型估计初生重,基于是否考虑初生重作为协变量的单性状动物模型估计2~12月龄各月龄体重遗传力,并利用双性状动物模型估计初生重与其它月龄体重的遗传相关。
【结果】对于初生重,根据赤池信息量准则(AIC),LM_H方法的拟合程度显著优于LM_A方法,但两种方法估计的遗传参数相差不大:直接遗传力分别为0.30和0.32,母体遗传力分别为0.08和0.09,个体直接遗传效应和母体遗传效应遗传相关系数分别为-0.65和-0.64;对于2~12月龄体重,LM_A和LM_H两种方法估计的校正初生重后的各月龄体重遗传力分别为0.15~0.55和0.28~0.49,未校正初生重的各月龄体重遗传力分别为0.16~0.54和0.28~0.51。初生重与2、5月龄体重之间为高遗传相关(相关系数>0.6)。5月龄后,各月龄体重与初生重的遗传相关系数随着时间间隔的增加而减小。相较于LM_A,LM_H方法更稳定,AIC值较小(即拟合优度较大),遗传参数标准误较小。
【结论】采用LM_H方法估计目标性状可获得更准确、更稳定的遗传参数。本研究为建立中国荷斯坦牛生长性状基因组选择体系提供了理论依据。